Seit dessen Release mehren sich die Berichte über fehlende Inhalte in Ninja Gaiden II Black. So fehlen über ein Dutzend Outfits, ein Mission Mode und ein Survival Mode. Auch ein New Game Plus Modus ist nicht vorzufinden. Ferner sind aus Ninja Gaiden Sigma 2 mehrere Outfits, ein Koop-Modus und Ninja Race Modus nicht vorhanden. Dafür sind Feinde an neuen Stellen platziert, während einige Bosse entfernt wurden, die damals viel Kritik einstecken mussten.
Ninja Gaiden II Black ist seit 23. Januar für PS5 und Xbox Series X erhältlich.